Il sistema Bajoriano è formato da quattordici pianeti. E' il sistema natale dei Bajoriani ed è situato nel Quadrante Alfa, nello spazio neutrale tra l'Unione Cardassiana e la Federazione Unita dei Pianeti, al centro del Quadrante 16.
Oltre ai quattordici nuclei solidi, nel sistema sono stati rilevati anche un numero imprecisato di nuclei gassosi e di ghiaccio.

Il pianeta principale, riportato semplicemente con il nome di Bajor, è il terzo e orbita intorno ad una stella gialla di medie dimensioni (nota curiosa è che la stella porta lo stesso nome). Esso è il pianeta madre dell'intera civiltà Bajoriana, razza umanoide dotata di un forte senso di spiritualità (che è servito a tenere unito il popolo in situazioni di estrema crisi) fiorita su questo pianeta almeno mezzo milione di anni or sono, dando vita a bellissime espressioni artistiche in svariati campi. Pianeta di classe M, Bajor ha cinque lune: la quarta, Durna, è attualmente disabitata (i Romulani avevano avuto il permesso di costruirvi un complesso ospedaliero, ma dopo la scoperta che esso veniva utilizzato anche come magazzino per i siluri al plasma il Governo Bajoriano li scacciò); la quinta è un planetoide, anch'esso di classe M, chiamato Jèraddo.

Nel 2369, poco dopo la fine dell'occupazione Cardassiana, cominciò l'estrazione del cuore liquido del planetoide, che venne usato come fonte per il primo trasferimento di energia su vasta scala. Grazie a Jèraddo si sarebbe potuto soddisfare il fabbisogno di energia di milioni di case su Bajor. L'estrazione del nucleo fuso rese però impossibile la vita su Jèraddo, a causa dei gas tossici liberati dai composti di carbonio e zolfo della crosta durante la procedura di lavorazione: la luna fu evacuata, i suoi cinquanta abitanti tornarono su Bajor. Molto comuni, sulle lune deserte, sono i Palukoo, forme di vita simili ai ragni. Sono commestibili e quando sono cucinati non sono neanche tanto male; in passato hanno spesso costituito l'unico nutrimento per i membri della Resistenza in molti dei campi base più remoti, come ad esempio sulla Base Lunar V, un antico forte costruito su una luna deserta, utilizzato durante l'Occupazione e ora abbandonato. Un certo numero di navi da incursione furono nascoste qui nel 2360 circa.

Del Sistema fanno parte anche:
Bajor VI: è il sesto pianeta del sistema Bajoriano. Sorge qui una base di costruzioni navali.
Bajor VII: è il settimo pianeta e possiede tre lune.
Bajor VIII: è l'ottavo pianeta del sistema, è di classe M ed ospita sei colonie Bajoriane; possiede due lune, la più bassa delle quali è chiamata Andros Due-B. Questo pianeta presenta un aspetto atipico: è raro, infatti, che un pianeta esterno ad un sistema solare possa supportare la vita, principalmente a causa della lontananza dalla stella.

Denorios Belt (Cintura di Denorios): cintura di piccole pietre, rocce e asteroidi che contorna il sole Bajoriano a una distanza di circa 200 milioni di chilometri. Esiste la teoria che l'anello di asteroidi precedentemente fosse un pianeta, distrutto da milioni di anni. All'interno della fascia si trova un campo di plasma caricato energicamente, che può ostacolare le navi durante l'attraversamento. Difficilmente le navi transitavano in questa zona e questo è il motivo per cui il Tunnel Spaziale, la cui apertura è localizzata qui, rimase celato per così lungo tempo. Durante i secoli ci sono stati 23 rapporti di disturbi mutazionali inusuali in questa zona. Cinque dei Sacri Cristalli di Bajor furono trovati qui. Questi potenti dispositivi ad energia a forma di clessidra, chiamati dai Bajoriani "Lacrime dei Profeti", hanno modellato la religione e gli ideali Bajoriani; la stessa Cintura è considerata la sede del Tempio Celeste, casa dei Profeti. Le informazioni fin qui riportate condussero, nel 2369, alla scoperta dell'unico tunnel spaziale stabile conosciuto: il Wormhole Bajoriano.

Wormhole Bajoriano (Tempio Celeste): è un tunnel spaziale artificiale (creato dai Profeti, le divinità Bajoriane) che collega il Quadrante Alfa al Quadrante Gamma, permettendo di coprire una distanza spaziale di circa 70.000 anni-luce in pochi secondi (la lunghezza del wormhole era stata stabilita in 90.000 anni-luce nell'episodio "Captive Pursuit", e diminuita a 70.000 nei successivi episodi). E' l'unico tunnel stabile finora conosciuto; tutti quelli osservati fino ad ora erano instabili e si mantenevano solo per poco tempo prima di collassare. Questi tunnel erano o fenomeni naturali o il risultato di malfunzionamenti della propulsione Warp. Il wormhole è composto da particelle stabili chiamate verteroni, capaci di mantenersi da sole in natura, e non esibisce nessuno dei normali schemi di fluttuazione quantica. Scoperto, come profetizzato, nel 2369 dall'Emissario Benjamin Sisko e dall'Ufficiale Scientifico Jadzia Dax, che entrarono anche in contatto con gli alieni che lo abitavano, permette il passaggio di vascelli spaziali a velocità impulso. Usare la velocità a curvatura all'interno del wormhole sarebbe infatti molto pericoloso, poichè si potrebbe creare un momentaneo "ponte" con l'universo-specchio scoperto dal Capitano Kirk nel 2267. I Bajoriani credono che il wormhole sia il Tempio Celeste, casa dei Profeti, che donarono i Sacri Cristalli al loro popolo, e che siano i Profeti stessi a guidare le navi attraverso il wormhole e a permettere che esse escano indenni dalla parte opposta del passaggio. Per questo motivo alcuni leader religiosi conservatori si oppongono fortemente all'insegnamento dei concetti scientifici sul funzionamento del wormhole. Quando qualcosa passa attraverso il tunnel i sensori rilevano un aumento di emissione di particelle neutriniche. A seguito della scoperta del tunnel la stazione spaziale DS9, che orbitava intorno a Bajor, fu spostata nei pressi della bocca del wormhole. Nel 2371 tre scienziati Cardassiani e il personale di DS9 collaborarono ad un progetto di comunicazione (vedi Terza Profezia di Tràkor) tra i Quadranti Alfa e Gamma attraverso il wormhole Bajoriano. Durante lo svolgimento del test alcuni frammenti di una cometa attraversarono il tunnel lasciando una scia di particelle di silithium, le quali crearono un filamento subspaziale che facilitò la propagazione delle onde-radio attraverso il tunnel stesso. Il wormhole Bajoriano va incontro ad una inversione subspaziale ogni cinquanta anni. Si tratta di uno spettacolare fenomeno durante il quale il subspazio vicino al wormhole si frammenta. L'ultima inversione subspaziale ebbe luogo nel 2372. Nel 2373, allo scopo di prevenire il fortificarsi delle forze del Dominio nello spazio Cardassiano, il Capitano Sisko tentò di chiudere permanentemente il wormhole usando gli emettitori di gravitoni della stazione per mandare fuori fase e far collassare la matrice spaziale del tunnel. Il piano per sigillare il tunnel fallì a causa del sabotaggio dell'equipaggiamento della stazione da parte di un Fondatore, che aveva assunto le sembianze del dottor Bashir. Come risultato la matrice spaziale del tunnel divenne ancora più stabile. Nemmeno l'esplosivo al trilithio fu in grado di distruggerlo. Sisko decise così di minare l'entrata del wormhole con mine auto-replicanti. L'apertura del wormhole è uno spettacolo meraviglioso, tanto che si è creata la superstizione di esprimere un desiderio quando lo si vede aprire, e questo desiderio si avvererà. Localizzazione wormhole: Denorios Belt, approssimativamente a 160 milioni di chilometri dal pianeta Bajor.

Orellius Minor: stella di tipo F localizzata nei pressi al wormhole. E' la seconda stella nel sistema binario. Sorge qui la colonia Paradise.

Runner (il Corridore): una costellazione visibile da Bajor e da DS9.

Badlands: regione di spazio vicina al confine Cardassiano colpita da frequenti e pericolose tempeste di plasma, che ne fanno una zona a rischio per i viaggi spaziali. Numerose navi infatti sono andate perdute in questa zona. Durante l'Occupazione molti membri della Resistenza si nascondevano nelle Badlands per sfuggire alle navi Cardassiane. Anche nell'universo-specchio le Badlands sono servite da rifugio per i membri della Resistenza Terrestre nella loro lotta contro l'Alleanza.

Prophets'Landing: è la colonia Bajoriana più vicina al confine Cardassiano, controllata dal Governatore Aresta. Nonostante il trattato di pace tra Bajor e Cardassia, che dovrebbe garantire l'incolumità della colonia, piattaforme con sensori orbitanti furono qui installate nel 2371 per dare l'allarme in caso di attacco.

Dreon VII: colonia Bajoriana relativamente vicina alle Badlands, a circa 12 ore di viaggio da Bajor. A circa metà strada tra Dreon VII e Bajor c'è nebulosa Rolla, che costituisce un serio rischio per la navigazione.

Free Haven: colonia Bajoriana che fu attaccata dalle navi corsare Breen nel 2372. I Breen furono allontanati grazie alla Defiant, che fu assegnata alla colonia per proteggerla.

Volnar: colonia situata nel settore Bajoriano.

Golana: pianeta colonizzato. Un'antica civiltà visse sul pianeta già 2000 anni prima che il mondo venisse colonizzato all'inizio del secolo. E' la principale destinazione delle persone che organizzano gite e pic-nic.

Hanolin: pianeta colonizzato, destinazione dei vascelli che hanno evacuato il personale da DS9 durante il colpo di Stato del 2370.

Koralis III: pianeta sul quale si trova un complesso minerario abbandonato.

Pullock V: luogo del primo raid "offworld" della Resistenza Bajoriana contro i Cardassiani.

Sistema di Goralis.

Sistema di Dozaria: sistema stellare con un solo pianeta di classe M la cui atmosfera è colma di interferenze ioniche, scoperto nel 2372 in seguito alle ricerche della Ravinok, una nave Cardassiana che sparì nel 2366 mentre trasportava 32 prigionieri Bajoriani e che era precipitata sul pianeta. I sopravvissuti furono catturati dai Breen e utilizzati come schiavi per minare i ricchi depositi di dilithio del pianeta.

Sistema di Korath: sistema stellare, destinazione dei vascelli che hanno evacuato il personale da DS9 durante il colpo di Stato del 2370.

Oltre ai pianeti appartenenti al Sistema Bajoriano, altri Sistemi e pianeti ospitano colonie Bajoriane. Molti dei pianeti disabitati di questo settore furono colonizzati dai Bajoriani nelle epoche passate, poichè gli antichi Bajoriani erano già a conoscenza del volo interstellare, come è provato da tentativi sperimentali basati su antichi disegni e dal ritrovamento di antichi relitti su altri pianeti nella zona di spazio dei Cardassiani. Essi usarono veicoli spaziali primitivi incorporandovi vele solari per tracciare mappe accurate del settore. La maggior parte dei pianeti abitabili all'interno del sistema e in quello vicino sono stati colonizzati nel corso del tempo ma poche di queste colonie sopravvivono ancora, eccetto su alcune lune Bajoriane e in alcuni resti di accampamenti in Sistemi vicini che furono neutri durante l'Occupazione.

Sistema di Valo: sistema solare situato nello spazio neutrale vicino al confine Cardassiano.
E' composto da tre pianeti di classe M, Valo I, Valo II e Valo III, sedi di numerosi campi profughi Bajoriani che si sono insediati qui durante l'Occupazione Cardassiana.
Valo I ha tre lune, la terza delle quali è stata un'importante roccaforte per alcuni gruppi della Resistenza grazie alla sua composizione, che rendeva impossibile la lettura dei sensori. Valo II e Valo III ospitano tuttora alcuni campi profughi.

Sistema di Ventar.

New Bajor: prima colonia Bajoriana stabilita in prossimità dell'uscita del wormhole nel Quadrante Gamma nel 2370. Possedeva un sistema di irrigazione avanzato. Il Dottor Bashir e il Maggiore Kira furono gli ultimi visitatori ufficiali: poche settimane dopo infatti, nel 2371, la colonia fu annientata e i Bajoriani massacrati dalle forze Jem'Hadar, come avvertimento a non intromettersi ulteriormente nella sfera d'azione del Dominion. Da allora nessuna colonizzazione è più stata tentata dai Bajoriani nel Quadrante Gamma, e un accordo è stato preso con il Dominion per ridurre la possibilità di attacchi.


Torniamo a parlare di Bajor. Questo pianeta ha grandi oceani che spezzano la crosta di terre emerse. Essi hanno un colore verde ben distinto; questo fenomeno può essere dovuto a materiali organici come microscopiche piante o alghe, o ad un'alta concentrazione di minerali o metalli. Il sottosuolo è ricco di Uridium, una sostanza minerale instabile. Quando si trova al suo stadio di base, l'uridium può esplodere se sottoposto a forti cariche elettriche. Il clima è di tipo tropicale sulla maggior parte del pianeta, con periodi di tempesta durante alcune stagioni dell'anno. Ci sono anche un buon numero d'aree deserte, molte delle quali dovute allo sfruttamento delle risorse Bajoriane durante l'Occupazione, anche se la maggior parte della terra spoglia lasciata dalle attività minerarie Cardassiane è stato bonificato. Un sistema esteso di acquedotti su tutta la terra emersa ne permette l'irrigazione e crea un sistema di trasporto.
Il pianeta è più grande della Terra e la sua gravità è circa 1.4 gravità terrestri; questo trova conferma nell'osservazione dei potenti muscoli dei Bajoriani, che si possono notare durante i combattimenti corpo a corpo, e nella conformazione del naso. Anche se la rotazione del pianeta è circa la stessa della Terra, essendo il suo diametro maggiore (tale che un punto sulla superficie traccia una linea più lunga di quanto non farebbe un punto sulla superficie terrestre durante una rotazione completa) la conseguenza è l'aumento della durata di una giornata di circa due ore (complessivamente 26 ore).